西藏自治区和新疆维吾尔自治区的卫生专业技术资格考试分数线相对较低。具体分数线如下：

西藏自治区

区直单位直属公立卫生健康机构及拉萨市直公立卫生健康机构：各科目成绩合格标准为55分。

日喀则市、山南市、林芝市、昌都市直公立卫生健康机构：各科目成绩合格标准为50分。

那曲市、阿里地区及全区县级（不含边境县）及以下卫生健康机构：各科目成绩合格标准为45分。

全区边境县及以下公立卫生健康机构：各科目成绩合格标准为40分。

新疆维吾尔自治区

自治区地州级及以上医疗卫生机构专业技术人员：各科目成绩合格标准为49分。

自治区县级及以下、南疆地区级医疗卫生机构专业技术人员：各科目成绩合格标准为43分。

南疆地区县级及以下医疗卫生机构专业技术人员：各科目成绩合格标准为37分。

这些地区均属于国家规定的单独划线地区，分数线较全国标准有所降低，以适应当地实际情况和需求。