东莞小学考试的命题机构主要有以下几种：

市教育局命题

小学考试卷一般由教育局命题，因为教育局是负责教育行政管理和监管的机构，拥有权威的教育资源和教学成果。教育局可以根据小学生的年龄、知识水平和教学进度等因素，根据课程标准要求和教学大纲制定试题。同时，教育局还可以通过征求教师、专家等相关人士的意见和建议，保证试题的质量和科学性。

区县教研室命题

小学期末考试试卷出题的有本学科组、本校或者本区或本县的教研室。如果是本校的考试，可以是本学科组出题。有时为了公平，学校组织人出题。如果是全县统考，则是由本县的教研室组织人出题。有时是外面出题机构买的试题。总之，根据考试的规模有不同的机构出题。

统一命题

为了考试的真实性，期末是统一命题的，而且是进行保密的，以免造成泄漏，而且考试期间是不准作弊的，监考老师会严格进行监考。

综合以上信息，东莞小学考试的命题机构可能是 市教育局、 区县教研室或 统一命题。具体由哪个机构命题，可能会根据考试的具体要求和规模有所不同。建议您关注东莞市教育局的官方信息，以获取最准确的命题机构信息。