在《仙剑奇侠传1》的最后一集，李逍遥对剑圣说的那句“你明白吗？”蕴含了多层含义，主要可以归纳为以下几点：

对宿命的质疑

李逍遥在这句台词中表达了对宿命论的质疑。他通过自己的经历和选择，反思了逆天与顺应宿命之间的纠葛。他不想像剑圣那样，虽然得道但却失去了爱的能力，认为真正的道不应该让人失去真挚的情感。

对剑圣得道的反思

李逍遥质问剑圣，即使他得道成仙，失去了爱，这样的道又有什么意义呢？他暗示剑圣的得道是偏执于放下情爱，而忽略了真挚爱情的重要性。李逍遥认为，正是因为剑圣的道，才导致了林月如等人的牺牲。

对爱与道的理解

李逍遥在这句台词中，也表达了对爱与道的深刻理解。他认为，真爱是超越一切界限的，是一切因果的根源。他通过自己的经历，明白了爱的力量，也明白了真正的道是包含情感的，而不是单纯地追求放下情感。

对剑圣情感变化的暗示

在剧情中，剑圣看到李逍遥独自一人抚养忆如，苍老了许多，心中充满了心疼。李逍遥的这句台词，也暗示了剑圣情感的变化，从最初的旁观者到最后的情感松动，他终于明白了李逍遥的道与他所感悟的道不同。

综上所述，李逍遥在最后一集对剑圣说的那句“你明白吗？”不仅是对宿命、爱情与道的深刻反思，也是对剑圣情感变化的暗示。这句台词留给观众很多思考的空间，让人去领悟人生的真谛和情感的力量。