小王子在寻找水井的过程中，通过多个层面说明了以下道理：

重要的事物往往是肉眼所不能察觉的

小王子告诉飞行员，星球之所以美丽，是因为有一朵我们看不到的花；沙漠之所以美丽，是因为在某处隐藏着一口水井。这表明，真正重要的东西并不总是显而易见的，需要用心去发现和感受。

希望是生命之源

小王子和飞行员在沙漠中经过长途跋涉，终于发现并“唤醒”了一眼“井”。这口井象征着希望、友谊与爱的力量，提醒人们在干涸的生活中寻找滋养心灵的源泉。希望是人可以不断坚持的方向标，支撑着他们不断前行。

心灵的需求高于物质的需求

小王子认为，水对心灵是有益的，沙漠的美丽在于某个地方隐藏了水井。这暗示了精神需求的重要性，表明人应该追求那些能够滋养心灵的东西，而不仅仅是物质上的满足。

用心才能感受到真正重要的东西

通过在沙漠找井的情节，小王子反复强调了用心才能感受到真正重要的东西。这与狐狸之前所说的“人只有用心去看，才能看到真实”相呼应，强调了主观意志和内心感受的重要性。

简单的事物往往蕴含着深刻的哲理

小王子和飞行员在沙漠中找到的水井，不仅是一口提供水源的井，更是一个象征，代表着生命的源泉和内心的净化。这提醒我们，最简单、最淳朴的事物往往蕴含着深刻的哲理和重要的智慧。

综上所述，小王子在寻找水井的过程中，通过多个层面说明了重要的事物需要用心去发现、希望是生命之源、心灵的需求高于物质的需求、用心才能感受到真正重要的东西以及简单的事物蕴含着深刻的哲理等道理。这些道理不仅适用于沙漠中的寻找，也适用于我们日常生活中的每一个选择。