在《海贼王》动漫中，汉库克·波雅（海贼女帝）并未被海军群歼。以下是相关情节的梳理：

海军与海军本部的行动

海军确实在女儿岛发动了针对波雅的军事行动，目的是逮捕她并带回海军本部。海军以大将缺席为由，仅派遣中将带队，但最终因女帝的霸王色霸气导致全军石化。

汉库克的逃脱与反击

- 尽管海军的攻击未能成功，汉库克仍成功逃脱并摧毁了海军的舰队。

- 她利用“俘虏之箭”能力击退了追击的海军，并在战斗中进一步削弱了海军的战斗力。

后续剧情发展

- 汉库克被克比擒获并送往海军本部，但并未被群歼。

- 她在海军本部被关押期间，仍保持高傲的性格，并与路飞等人保持联系。

综上，汉库克在动漫中虽然经历了海军的追捕和攻击，但并未被海军群歼。她的逃脱和反击进一步展现了她强大的实力和坚韧的性格。