究竟、到底和毕竟在汉语中都表示“最终结果”或“追根究底”的含义，但它们在用法和语气上有明显区别，具体分析如下：

一、核心差异

语气功能

- 究竟：

主要用于疑问句，表示对事情原因或结果的追问，带有不确定性和探求语气。例如：

> 这究竟是怎么回事？（表示不知道具体原因）

- 到底：多用于陈述句，强调经过曲折过程后的最终结果，语气肯定。例如：

> 经过调查，问题终于水落石出

- 毕竟：多用于陈述句，表示对已知事实的总结性结论，带有主观评价色彩。例如：

> 这本书虽然有缺页，但毕竟是珍本

使用场景区分

- 究竟：

疑问句专用，如：

> 他究竟是出于什么考虑？

- 到底：陈述句专用，如：

> 经过反复试验，新方法到底有效了

- 毕竟：可接在陈述句中，如：

> 毕竟合作是双方共同的目标

二、用法特点

语义侧重点

- 究竟：

侧重过程，强调“追根究底”的动作。例如：

> 我们必须查清楚事情的究竟

- 到底：侧重结果，强调“最终状态”。例如：

> 会议进行到下午三点，讨论终于结束

- 毕竟：侧重结论，带有情感色彩（如欣慰、遗憾等）。例如：

> 毕竟亲情是无法替代的

可互换性

- 在表示“最终结果”的陈述句中，三者可互换使用，但“毕竟”语气更强烈，常带有总结性评价。例如：

> 他究竟/到底/毕竟是个天才

- 在疑问句中，通常只能用“究竟”，如：

> 这究竟是怎么回事？（不能说“这到底是怎么回事？”）

三、近义词辨析

与“到底”的区别：

“到底”多用于描述过程或时间上的终点（如“一竿子到底”），而“究竟”仅用于结果或原因的追问。

与“终归”的区别：

“终归”强调“最终必然”的结果（如“终归会成功”），而“毕竟”侧重已发生事实的总结。

四、使用建议

疑问句：优先使用“究竟”，如：

> 这究竟是怎么回事？

陈述句：根据语境选择“毕竟”（总结性结论）或“到底”（过程终点），如：

> 这本书毕竟是经典，/ 经过努力，问题终于解决。

通过以上分析，可根据句子类型和语境灵活选择使用，注意区分疑问、陈述和总结性表达。